鄂尔多斯市中心医院始建于1950年，是鄂尔多斯唯一的三级甲等综合医院，是内蒙古医科大学临床医学院，成立了内蒙古超声医学研究所，是自治区超声质量控制中心，拥有国家级临床重点专科重症医学科和自治区领先学科超声医学科。有影像科、骨科、普通外科、眼科等16个市级领先重点学科。

医院是国家卫计委临床药师培训基地和国家住院医师规范化培训基地。建立了国家消化病临床医学研究中心鄂尔多斯市中心医院分中心、京蒙合作消化疾病医疗中心、内蒙古自治区第三个胸痛中心。腔镜技术、超声医学、影像医学等专业水平居于自治区先进地位。消毒供应中心是自治区实践基地。建成国家心力衰竭医联体内蒙古自治区中心，神经专业、肿瘤专业、心内专业、呼吸专业成为自治区临床医学研究中心核心成员单位。医院设置康巴什部和东胜部，总建筑面积26万平方米，开放床位1701张。年服务的门诊人次、住院人次居自治区前列。拥有PET-CT、宝石CT、3.0T核磁共振、彩超、血管造影机等先进医疗设备。